• Главная
  • Карта сайта

Биология и природа вокруг нас ...

Главное меню

  • На главную
  • Гидросфера и атмосфера Земли
  • Функциональная асимметрия мозга
  • Строение клеток растений
  • Анатомия человека
  • Человек как биологический вид
  • Процесс антропогенеза
  • Естествознание в системе наук

Исходные параметры задачи

В качестве исходных данных для задачи выступают:

§ геометрические параметры (радиус, шаг витка) винтовой линии третичной структуры для свободного состояния молекулярной цепи РНК;

§ длина и ориентация Уотсон-Криковских связей для свободного состояния молекулярной цепи РНК;

§ количество нуклеотидов в каждом элементе вторичной структуры для напряжённого состояния молекулы РНК;

§ номер и тип (стебель либо один из 4-х видов петель) каждого элемента вторичной структуры напряжённого состояния РНК;

§ механические характеристики для элементов вторичной структуры (изгибные и крутильные жёсткости).

Под механическими характеристиками для элементов вторичной структуры подразумеваются крутильные и изгибные коэффициенты жёсткости для стержня, который соответствует свободному состоянию молекулярной цепи РНК. Стержни, соответствующие этим элементам, предполагаются однородными

- то есть эти коэффициенты являются константами, не зависящими от длины участка данного стержня.

Так как молекула РНК, в отличии от молекулы ДНК, может принимать практически произвольные формы, то возникает задача определить истинную третичную форму

молекулы РНК - форму, которую принимает молекула, находящаяся в равновесии. Из механики твёрдого тела (см. [6]) известно, что равновесному состоянию тела соответствует состояние, при котором значение упругой энергии тела достигает минимума.

Под упругой энергией стержня

понимается работа, которая была совершена какими-то внешними силами при переводе этого стержня из свободного состояния в данное. Из аксиом линейной теории упругости (см. [2]) следует, что она потенциальна и аддитивна - поэтому упругая энергия всей молекулы равна сумме упругих энергий её элементов, соответствующих вторичной структуре.

Copyright © 2013 - Все права защищены